Иглы эти вместе с поршеньками должны ходить совершенно свободно и радостно выпрыгивать вверх под действием пружинок возвратных. ... Насос качает и забивает фильтр или сетку грязью. Машина постоит, часть бензина отливается обратно к насосу, таким образом освобождая немного протока для бенза. Какое-то время, пока снова остатки пропускных отверстий не забьются грязью. .... у меня было именно так. поставил бензиновый мотор вместо дизеля. бак конечно не мыл, нафиг надо... И были симптомы почти как у тебя. после долгих изысканий достал заборник из бака а там вся сетка в мерзкой слизи... без нагрузки "на холостых" как бы ты не газовал, расход топлива сильно меньше, чем при движении. тем более на подъём. то есть вполне возможно найден редкий баланс подачи топлива точно для работы мотора без нагрузки. но стоит её чуточку прибавить и топлива уже не хватает) ... но совершенно не факт что я прав. возможно так странно подыхает електронасос. ... иглы у меня недавно подклинивали, правда на рочстере. при движении выше средней нагрузки - рывки провалы и "бэкфайер". Но на малых режимах совершенно не ощущалось... В принципе можно было по пенсионерски хоть целый день тошнить. А чего у тебя за иглы стоят? У меня есть штук 30, могу одну подарить через Ская например) ... изменения вакуума как следствие некорректной работы мотора из-за нехватки топлива вполне могут произойти. 

Освобождаю мозг от суеты... Парни, а не может гнутая игла Primary Metering Rod давать такие симптомы? Да, я копался в поплавковой камере, а когда ставил её обратно, погнул одну из игл. Выпрямил, конечно, но при засовывании в корпус есть усилие. Хотя симптомы были и до того, как я туда залез.       Думал и насчет бензонасоса, и насчет грязи в баке. Но почему же на холодную всё отлично? Почему, если даже на горячую съехать на обочину, включить Паркинг и газовать в пол, то всё ок?   Проблема только под нагрузкой появляется. И да, наблюдения насчет вакуума - на холодную всё отлично, тормоза встают колом, если слегка нажать на педаль. Коробка переключает, как вариатор, в том числе R и D. А вот тогда, когда начинаются симптомы hesitation, тормоза уже вялые, нога на педали ближе к полу, а коробка подпинывает.   Хз, попробую через тройники подключить манометр и вакууметр скотчем к лобовому и так ездить.

Если не насос, то фильтр топливный. Или сетка в баке. ....  Были у меня много лет назад подобные симптомы. Сетка в баке дерьмом каким-то забилась.

А коды неисправностей пропали? 

Надо освободить мозг(свой) от суеты.  Ответ где-то рядом, но разум не даёт воспользоваться подсознанием.